Co je PGT-M?

​

Preimplantační genetické testování monogenních onemocnění (PGT-M), dříve preimplantační genetická diagnostika (PGD) je určena pro páry, kde je prokázáno riziko přenosu závažného genetického onemocnění, které je přenášeno poruchou jednoho genu z rodičů na potomka. PGT-M v naší laboratoři již od roku 2014 provádíme metodou Karyomapping a nově od roku 2021 také námi vyvinutou metodou s názvem OneGene PGT.

 

 

Co je karyomapping?

​​

Karyomapping je univerzální metoda kombinující preimplantační genetické testování monogenních chorob (PGT-M) a preimplantačního genetického testování aneuploidií (PGT-A) vyšetřovaných embryí v jednom testu, které umožňuje vybrat euploidní embryo bez genetické zátěže s nejvyšším implantačním potenciálem.

​

Co je OneGene PGT?

 

Podobně jako Karyomapping kombinuje metoda OneGene PGT preimplantační genetické testování monogenních chorob a aneuploidií v jednom testu. Navíc tato nová metoda umožňuje přímou detekci mutací u embryí.

V současnosti je metoda akreditována pro tato onemocnění: cystická fibróza (gen CFTR), hereditární karcinomy prsu a ovárií (BRCA1 a BRCA2), hemoglobinopatie (HBB), Huntingtonova choroba (HTT), syndrom fragilního X-chromozomu (FMR1) a nesyndromová hluchota (GJB2).

 

Pro koho je PGT-M vhodné?

​

PGT-M je určeno pro všechny páry s genetickou zátěží v rodině, kteří plánují těhotenství a chtějí mít jistotu narození zdravého potomka. Karyomapping lze aplikovat na všechny choroby s mendelistickým typem dědičnosti (autozomálně dominantní/recesivní, X – vázané), OneGene PGT na choroby spojenými se 7 vybranými geny.

 

Co je nutné vědět před zahájením PGT-M?

​

Před zahájením IVF s PGT-M je nezbytně nutné znát kauzální mutaci způsobující dané genetické onemocnění

v rodině. K úspěšné analýze je potřeba kromě embryí vyšetřit také DNA obou rodičů a referenčního vzorku se známým genotypem pro kauzální mutaci. Typickým příkladem u autozomálně recesivní choroby jsou rodiče přenašeči pro cystickou fibrózu a referenčním vzorkem je jejich dítě s diagnostikovanou cystickou fibrózou. Vyšetření lze v určitých situacích provést i bez referenčního vzorku (de-novo mutace). V těchto případech je u embryí navíc provedena přímá detekce mutace, která v kombinaci s vazebnou analýzou dokáže spolehlivě odhalit, které embrya jsou bez genetické zátěže. V tomto případě je velmi důležité proveditelnost vyšetření nejprve konzultovat s naší genetickou laboratoří.

 

Jak to funguje?

​

Karyomapping využívá k nepřímé diagnostice monogenních onemocnění více než 300 000 polymorfních sekvencí (takzvaných SNP) rovnoměrně rozložených po celém genomu. Analýzou těchto sekvencí dochází k vytvoření tzv. karyomapy, která vizualizuje haplotypové rozložení všech chromozomů včetně crossing–overů ve vyšetřovaném embryu. V prvním kroku jsou identifikovány informativní SNP, které umožňují určit každý ze čtyř parentálních haplotypů (dva paternální označované jako P1 aP2 a dva maternální M1 a M2), které zjednodušeně reprezentují každý ze čtyř rodičovských chromozomů. Tyto informativní SNP jsou následně srovnány s genotypem referenčního vzorku a umožňují určit „fázi“ reprezentující, které dva ze čtyř parentálních haplotypů reference zdědila. Ve výše zmíněném případě, kdy jsou oba rodiče přenašeči pro Cystickou fibrózu a reference jejich dítě s Cystickou fibrózou, lze identifikovat, které parentální haplotypy reprezentují haplotypy s kauzálními mutacemi. V posledním kroku dochází k porovnání těchto haplotypů u reference a vyšetřovaných embryí. Pokud jsou u embrya identifikovány shodné haplotypy jako u referenčního vzorku, lze na základě nepřímé diagnostiky podpořené desítkami informativních SNP v okolí mutace, spolehlivě predikovat, že embryo zdědilo obě alely s mutací pro cystickou fibrózu.

Metoda OneGene PGT pracuje na stejném principu jako karyomapping, jen s tím rozdílem, že sledované SNP markery nejsou rozmístěny po celém genomu, ale pouze v oblasti kolem vyšetřovaného genu. Na rozdíl od metody Karyomapping je OneGene PGT založen na Nové Generaci Sekvenování (NGS), což nám ve většině případů také umožňuje detekovat kauzální mutaci přímo u embryí. Zvyšuje se tak spolehlivost haplotypové vazebné analýzy.

 

Jaké jsou výhody metody karyomapping?

​

Jednou z hlavních výhod karyomappingu je její univerzálnost. Díky rovnoměrnému pokrytí informativních SNP po celém genomu umožňuje vyšetřit opravdu jakékoliv genetické onemocnění s kauzální mutací. Díky této univerzálnosti, není potřeba zdlouhavé optimalizace postupu pro jednotlivé rodiny, který typicky trvá několik měsíců a je možné vyšetření provést výrazně rychleji v řádu týdnů. Další výhodou je současná detekce aneuploidií u vyšetřovaných embryí, která výrazně zvyšuje šanci na úspěšnost léčby.

​

Jaké jsou výhody metody OneGene PGT?

​

Díky využití NGS technologie nám metoda OneGene PGT umožňuje také přímou detekci mutace u embryí, což velmi výrazně zvyšuje spolehlivost vyšetření. NGS také poskytuje lepší rozlišení při detekci chromozomových aberací a chromozomového mozaicismu u embryí ve srovnání s čipovou technologií metody Karyomapping. V neposlední řadě je tato nová metoda časově i finančně efektivnější.